Forskning ved Københavns Universitet - Københavns Universitet

Forside
Mathias Middelboe
Mathias Middelboe

Professor


  1. Udgivet

    Sharp contrasts between freshwater and marine microbial enzymatic capabilities, community composition, and DOM pools in a NE Greenland fjord

    Balmonte, J. P., Hasler-Sheetal, H., Glud, R. N., Andersen, Thorbjørn Joest, Sejr, M. K., Middelboe, Mathias, Teske, A. & Arnosti, C., 2020, I : Limnology and Oceanography. 65, 1, s. 77-95 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  2. Udgivet

    Influence of bacterial uptake on deep-ocean dissolved organic carbon

    Bendtsen, J., Lundsgaard, C., Middelboe, Mathias & Archer, D., 2002, I : Global Biogeochemical Cycles. vol. 16(0), s. 1-13

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  3. Udgivet

    Marine Viruses: Community Dynamics, Diversity and Impact on Microbial Processes

    Breitbart, M., Middelboe, Mathias & Rohwer, F., 2008, Microbial Ecology of the Oceans. Second Edition udg. IEEE Computer Society Press, s. 443-479

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskning

  4. Udgivet

    Global-scale processes with a nanoscale drive - the role of marine viruses

    Brussard, C. P. D., Wilhelm, S. W., Thinhstad, T. F., Weinbauer, T. F., Bratbak, M. G., Heldal, M., Kimmance, S. A., Middelboe, Mathias, Nagasaki, K., Paul, J. H., Schroeder, D. C., Suttle, C. A., Vaque, D. & Wommack, K. E., 2008, I : ISME Journal. 2, s. 575-578

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Counting viruses and bacteria in photosynthetic microbial mats

    Carreira, C., Staal, M. J., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : Applied and Environmental Microbiology. 81, 6, s. 2149-2155 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. Udgivet

    Autofluorescence imaging system to discriminate and quantify the distribution of benthic cyanobacteria and diatoms

    Carreira, C., Staal, M. J., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : Limnology and Oceanography: Methods. 13, 4, s. 169-177 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  7. Udgivet

    Heterogeneous distribution of prokaryotes and viruses at the microscale in a tidal sediment

    Carreira, C., Larsen, M., Glud, R. N., Brussaard, C. P. D. & Middelboe, Mathias, 2013, I : Aquatic Microbial Ecology. 69, 3, s. 183-192 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Microscale spatial distributions of microbes and viruses in intertidal photosynthetic microbial mats

    Carreira, C., Piel, T., Staal, M. J., Stuut, J. W., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : SpringerPlus. 4, 11 s., 239.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Disruption of photoautotrophic intertidal mats by filamentous fungi

    Carreira, C., Staal, M. J., Falkoski, D., de Vries, R. P., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : Environmental Microbiology. 17, 8, s. 2910-2921 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Diversity of Flavobacterium psychrophilum and the potential use of its phages for protection against bacterial cold water disease in salmonids

    Castillo, D., Higuera, G., Villa, M., Middelboe, Mathias, Dalsgaard, I., Madsen, L. & Espejo, R. T., 2012, I : Journal of Fish Diseases Online. 35, 3, s. 193-201 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Large Phenotypic and Genetic Diversity of Prophages Induced from the Fish Pathogen Vibrio anguillarum

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Andersen, N., Kalatzis, Panagiotis & Middelboe, Mathias, 2019, I : Viruses. 11, 11, 15 s., 983.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Widespread distribution of prophage-encoded virulence factors in marine Vibrio communities

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Kauffman, K., Hussain, F., Kalatzis, Panagiotis, Rørbo, N., Polz, M. F. & Middelboe, Mathias, 2018, I : Scientific Reports. 8, s. 1-9 9973.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Draft Genome Sequences of Six Vibrio diazotrophicus Strains Isolated from Deep Subsurface Sediments of the Baltic Sea

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Vandieken, V., Engelen, B., Engelhardt, T. & Middelboe, Mathias, 2018, I : Genome Announcements. 6, 10, s. 1-2 e00081-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Phage defense mechanisms and their genomic and phenotypic implications in the fish pathogen Vibrio anguillarum

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Rørbo, N., Jørgensen, Jóhanna, Lange, J., Tan, D., Kalatzis, Panagiotis, Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2019, I : FEMS Microbiology Ecology. 95, 3, fiz004.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Bacteriophage resistance mechanisms in the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum: linking genomic mutations to changes in bacterial virulence factors

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Cristiansen, R. H., Dalsgaard, I., Madsen, L. & Middelboe, Mathias, 2015, I : Applied and Environmental Microbiology. 81, 3, s. 1157-1167 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. Udgivet

    Draft genome sequences of the fish pathogen Vibrio harveyi strains VH2 and VH5

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, D'Alvise, P., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C. & Katharios, P., 2015, I : Genome Announcements. 3, 5, 2 s., e01062-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  17. Udgivet

    Draft genome sequences of Vibrio alginolyticus strains V1 and V2, opportunistic marine pathogens

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, D'Alvise, P., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S. & Katharios, P., 2015, I : Genome Announcements. 3, 4, 2 s., e00729-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Genomic structure of bacteriophage 6H and its distribution as prophage in Flavobacterium psychrophilum strains

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2014, I : FEMS Microbiology Letters. 351, 1, s. 51-58 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Diversity and geographical distribution of Flavobacterium psychrophilum isolates and their phages: patterns of susceptibility to phage infection and phage host range

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Christiansen, R. H., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2014, I : Microbial Ecology. 67, 4, s. 748-757 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Draft genome sequence of Vibrio parahaemolyticus VH3, isolated from an Aquaculture environment in Greece

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Jun, J. W., D'Alvise, P., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S. & Katharios, P., 2015, I : Genome Announcements. 3, 4, 2 s., e00731-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Comparative genome analyses of Vibrio anguillarum strains reveal a link with pathogenicity traits

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Alvise, P. D., Xu, R., Zhang, F., Middelboe, Mathias & Gram, L., 28 feb. 2017, I : mSystems. 2, 1, 14 s., e00001-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. Udgivet

    Comparative genome analysis provides Insights into the pathogenicity of Flavobacterium psychrophilum

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Christiansen, R. H., Dalsgaard, I., Madsen, L., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2016, I : P L o S One. 11, 4, 18 s., e0152515.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  23. Udgivet

    Genomic diversity of bacteriophages infecting the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum

    Castillo Bermúdez, Daniel Elías & Middelboe, Mathias, 2016, I : F E M S Microbiology Letters. 363, 24, 6 s., fnw272.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Primer Registro de Abundancia Viral en Bahia Coliumo y Plataforma Continental Frente a Chile Central: First Record of Viral Abundance in Coliumo Bay and the Continental Shelf off Central Chile.

    Chiang, O. E., Middelboe, Mathias & Quiñones, R. A., 2007, I : Gayana. 71, 1, s. 124-131

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  25. Udgivet

    First Record of Viral Abundance in Coliumo Bay and the Continental Shelf off Central Chile

    Chiang, O. E., Middelboe, Mathias & Quiñones, R. A., 2007, I : Gayana. 71, 1, s. 124-131

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Detection and quantification of Flavobacterium psychrophilum-specific bacteriophages In Vivo in rainbow trout upon oral administration: implications for disease control in aquaculture

    Christiansen, R. H., Dalsgaard, I., Middelboe, Mathias, Lauritsen, A. H. & Madsen, L., 2014, I : Applied and Environmental Microbiology. 80, 24, s. 7683-7693 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Effect of bacteriophages on the growth of Favobacterium psychrophilum and development of phage-resistant strains

    Christiansen, R. H., Madsen, L., Dalsgaard, I., Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Kalatzis, P. G. & Middelboe, Mathias, 2016, I : Microbial Ecology. 71, 4, s. 845-859 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Separation of free viruses from sediments in aquatic systems.

    Danovaro, R. & Middelboe, Mathias, 2010, Manual of Aquatic Viral Ecology. ASLO.. Wilhelm, S. W., Weinbauer, M. G. & Suttle, C. A. (red.). Waco, Tex: ASLO, s. 74-81 7 s.

    Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapportBidrag til bog/antologiForskningfagfællebedømt

  29. Udgivet

    Ny viden om virus' betydning for Jordens kulstofomsætning.

    Drejet, L. & Middelboe, Mathias, 2007, I : Dansk Kemi. 88, 2, s. 11-13

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelFormidling

  30. Udgivet

    Viral abundance and genome size distribution in the sediment and water column of marine and freshwater ecosystems

    Filippini, M. & Middelboe, Mathias, 2007, I : FEMS Microbiology Ecology. 60, s. 397-410

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Virus and bacteria dynamics of a coastal sediment: Implication for benthic carbon cycling.

    Glud, R. N. & Middelboe, Mathias, 2004, I : Limnology and Oceanography. 49(6), s. 2073-2081

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Havbunden - et levested for vigtige aktører i havets husholdning

    Glud, R. N. & Middelboe, Mathias, 2006, I : Naturens Verden. 11/12, s. 2-9

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskning

  33. Udgivet

    Distribution of oxygen in surface sediments from central Sagami Bay, Japan: In situ measurements by microelectrodes and planar optodes

    Glud, R. N., Wenzhöfer, F., Tengberg, A., Middelboe, Mathias, Oguri, K. & Kitazato, H., 2005, I : Deep Sea Research - Part I - Oceanographic Research Papers. Part I (52), s. 1974-1987

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    High rates of microbial carbon turnover in sediments in the deepest oceanic trench on Earth

    Glud, R. N., Wenzhöfer, F., Middelboe, Mathias, Oguri, K., Turnewitsch, R., Canfield, D. E. & Kitazato, H., 2013, I : Nature Geoscience. 6, s. 284-288 5 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Utilization of marine sedimentary dissolved organic nitrogen by native anaerobic bacteria

    Guldberg, L. B., Finster, K., Jørgensen, Niels O. G., Middelboe, Mathias & Lomstein, B. A., 2002, I : Limnology and Oceanography. 47, 6, s. 1712-1722 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Viral lysis of Phaeocystis pouchetii: implications for algal population dynamics and heterotrophic C, N and P cycling

    Haaber, J. B. B. & Middelboe, Mathias, 2009, I : ISME Journal. 3, 4, s. 430-441 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. Udgivet

    Big Impact of the Tiny: Bacteriophage–Bacteria Interactions in Biofilms

    Hansen, M. F., Svenningsen, Sine Lo, Røder, Henriette Lyng, Middelboe, Mathias & Burmølle, Mette, 2019, I : Trends in Microbiology. 27, 9, s. 739-752 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  38. Udgivet

    Effects of allochthonous dissolved organic matter input on microbial composition and nitrogen-cycling genes at two contrasting estuarine sites

    Happel, E. M., Markussen, T. M., Teikari, J. E., Huchaiah, V., Alneberg, J., Andersson, A. F., Sivonen, K., Middelboe, Mathias, Kisand, V. & Riemann, Lasse, 2019, I : F E M S Microbiology Ecology. 95, 9, 10 s., fiz123.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    P. aeruginosa flow-cell biofilms are enhanced by repeated phage treatments but can be eradicated by phage-ciprofloxacin combination: —monitoring the phage–P. aeruginosa biofilms interactions

    Henriksen, K., Rørbo, N., Rybtke, Morten Levin, Martinet, M. G., Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels, Middelboe, Mathias & Ciofu, Oana, 2019, I : Pathogens and Disease. 77, 2, 11 s., ftz011.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Large variabilities in host strain susceptibility and phage host range govern interactions between lytic marine phages and their Flavobacterium hosts

    Holmfeldt, K., Middelboe, Mathias, Nybroe, O. & Riemann, L., 2007, I : Applied and Environmental Microbiology. 73, 21, s. 6730-6739 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Cultivated single stranded DNA phages that infect marine Bacteroidetes prove difficult to detect with DNA binding stains

    Holmfeldt, K., Odic, D., Sullivan, M. B., Middelboe, Mathias & Riemann, Lasse, 2012, I : Applied and Environmental Microbiology. 78, 3, s. 892-894

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Global trends in the fluorescence characteristics and distribution of marine dissolved organic matter

    Jørgensen, L., Stedmon, C., Kragh, Theis, Markager, S., Middelboe, Mathias & Nielsen, Morten Søndergaard, 2011, I : Marine Chemistry. 126, 1-4, s. 139-148 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Tracing the long-term microbial production of recalcitrant fluorescent dissolved organic matter in seawater

    Jørgensen, L., Stedmon, C. A., Granskog, M. A. & Middelboe, Mathias, 2014, I : Geophysical Research Letters. 41, 7, s. 2481-2488 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLetterForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Production and transformation of dissolved neutral sugars and amino acids by bacteria in seawater

    Jørgensen, L., Lechtenfeld, O. J., Benner, R., Middelboe, Mathias & Stedmon, C. A., 2014, I : Biogeosciences. 11, s. 5349-5363 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Changes in the composition and bioavailability of dissolved organic matter during sea ice formation

    Jørgensen, L., Stedmon, C. A., Kaartokallio, H., Middelboe, Mathias & Thomas, D. N., 2015, I : Limnology and Oceanography. 60, 3, s. 817-830 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Occurrence and bacterial cycling of D amino acid isomers in an estuarine environment

    Jørgensen, Niels O. G. & Middelboe, Mathias, 2006, I : Biogeochemistry. 81, 1, s. 77-94 18 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Bacteriophage Interactions with Marine Pathogenic Vibrios: Implications for Phage Therapy

    Kalatzis, Panagiotis, Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 2018, I : Antibiotics. 7, 1, 23 s., 15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Stumbling across the same phage: comparative genomics of widespread temperate phages infecting the fish pathogen Vibrio anguillarum

    Kalatzis, Panagiotis, Rørbo, N. I., Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Mauritzen, J. J., Jørgensen, Jóhanna, Kokkari, C., Zhang, F., Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 20 maj 2017, I : Viruses. 9, 5, 19 s., 122.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Complete Genome Sequence of Vibrio anguillarum Nontailed Bacteriophage NO16

    Kalatzis, Panagiotis, Carstens, A. B., Katharios, P., Castillo Bermúdez, Daniel Elías, Hansen, L. H. & Middelboe, Mathias, 2019, I : Microbiology resource announcements. 8, 15, s. 1-2 e00020-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Isolation and characterization of a N4-like lytic bacteriophage infecting Vibrio splendidus, a pathogen of fish and bivalves

    Katharios, P., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C., Sarropoulou, E. & Middelboe, Mathias, 28 dec. 2017, I : PLoS ONE. 12, 12, 14 s., e0190083.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 8392