Forskning ved Københavns Universitet - Københavns Universitet

Forside
Mathias Middelboe
Mathias Middelboe

Professor


  1. 2020
  2. Udgivet

    Bacteriophages: Emerging Applications in Medicine, Food, and Biotechnology

    Sohail, H. A., Coffey, A., Debrowska, K., Meyer, I. M., Middelboe, Mathias, Sohail, M. & Clokie, M. R. J., 2020, I : PHAGE: Therapy, Applications, and Research. 1, 2, s. 75-82 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftKonferenceartikelFormidling

  3. Udgivet

    Beyond Cholera: Characterization of zot-Encoding Filamentous Phages in the Marine Fish Pathogen Vibrio anguillarum

    Mauritzen, Jesper Juel, Castillo, D., Tan, D., Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2020, I : Viruses. 12, 7, 17 s., 730.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  4. Udgivet

    High cell densities favor lysogeny: induction of an H20 prophage is repressed by quorum sensing and enhances biofilm formation in Vibrio anguillarum

    Tan, D., Hansen, M. F., de Carvalho, L. N., Røder, Henriette Lyng, Burmølle, Mette, Middelboe, Mathias & Svenningsen, Sine Lo, 2020, I : The ISME Journal. 14, 7, s. 1731-1742 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  5. Udgivet

    Sharp contrasts between freshwater and marine microbial enzymatic capabilities, community composition, and DOM pools in a NE Greenland fjord

    Balmonte, J. P., Hasler-Sheetal, H., Glud, R. N., Andersen, Thorbjørn Joest, Sejr, M. K., Middelboe, Mathias, Teske, A. & Arnosti, C., 2020, I : Limnology and Oceanography. 65, 1, s. 77-95 19 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  6. 2019
  7. Udgivet

    P. aeruginosa flow-cell biofilms are enhanced by repeated phage treatments but can be eradicated by phage-ciprofloxacin combination: —monitoring the phage–P. aeruginosa biofilms interactions

    Henriksen, K., Rørbo, N., Rybtke, Morten Levin, Martinet, M. G., Tolker-Nielsen, Tim, Høiby, Niels, Middelboe, Mathias & Ciofu, Oana, 2019, I : Pathogens and Disease. 77, 2, 11 s., ftz011.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  8. Udgivet

    Big Impact of the Tiny: Bacteriophage–Bacteria Interactions in Biofilms

    Hansen, M. F., Svenningsen, Sine Lo, Røder, Henriette Lyng, Middelboe, Mathias & Burmølle, Mette, 2019, I : Trends in Microbiology. 27, 9, s. 739-752 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  9. Udgivet

    Biological transformation of Arctic dissolved organic matter in a NE Greenland fjord

    Paulsen, M. L., Müller, O., Larsen, A., Møller, E. F., Middelboe, Mathias, Sejr, M. K. & Stedmon, C., 2019, I : Limnology and Oceanography. 64, 3, s. 1014-1033

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  10. Udgivet

    Combining probiotic Phaeobacter inhibens DSM17395 and broad-host-range vibriophage KVP40 against fish pathogenic vibrios

    Rasmussen, B. B., Kalatzis, Panagiotis, Middelboe, Mathias & Gram, L., 2019, I : Aquaculture. 513, 7 s., 734415.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  11. Udgivet

    Complete Genome Sequence of Vibrio anguillarum Nontailed Bacteriophage NO16

    Kalatzis, Panagiotis, Carstens, A. B., Katharios, P., Castillo, D., Hansen, L. H. & Middelboe, Mathias, 2019, I : Microbiology resource announcements. 8, 15, s. 1-2 e00020-19.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  12. Udgivet

    Effects of allochthonous dissolved organic matter input on microbial composition and nitrogen-cycling genes at two contrasting estuarine sites

    Happel, E. M., Markussen, T. M., Teikari, J. E., Huchaiah, V., Alneberg, J., Andersson, A. F., Sivonen, K., Middelboe, Mathias, Kisand, V. & Riemann, Lasse, 2019, I : F E M S Microbiology Ecology. 95, 9, 10 s., fiz123.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  13. Udgivet

    Large Phenotypic and Genetic Diversity of Prophages Induced from the Fish Pathogen Vibrio anguillarum

    Castillo, D., Andersen, N., Kalatzis, Panagiotis & Middelboe, Mathias, 2019, I : Viruses. 11, 11, 15 s., 983.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  14. Udgivet

    Phage defense mechanisms and their genomic and phenotypic implications in the fish pathogen Vibrio anguillarum

    Castillo, D., Rørbo, N., Jørgensen, Jóhanna, Lange, J., Tan, D., Kalatzis, Panagiotis, Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2019, I : FEMS Microbiology Ecology. 95, 3, fiz004.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  15. Udgivet

    Phenotypic and Genetic Predictors of Pathogenicity and Virulence in Flavobacterium psychrophilum

    Sundell, K., Landor, L., Nicolas, P., Jørgensen, Jóhanna, Castillo, D., Middelboe, Mathias, Dalsgaard, I., Donati, V. L., Madsen, L. & Wiklund, T., 2019, I : Frontiers in Microbiology. 10, 14 s., 1711.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  16. 2018
  17. Udgivet

    Bacteriophage Interactions with Marine Pathogenic Vibrios: Implications for Phage Therapy

    Kalatzis, Panagiotis, Castillo Bermúdez, D. E., Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 2018, I : Antibiotics. 7, 1, 23 s., 15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftReviewForskningfagfællebedømt

  18. Udgivet

    Coupling biogeochemical process rates and metagenomic blueprints of coastal bacterial assemblages in the context of environmental change

    Markussen, T. M., Happel, E. M., Teikari, J. E., Huchaiah, V., Alneberg, J., Andersson, A. F., Sivonen, K., Riemann, Lasse, Middelboe, Mathias & Kisand, V., 2018, I : Environmental Microbiology. 20, 8, s. 3083-3099

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  19. Udgivet

    Draft Genome Sequences of Six Vibrio diazotrophicus Strains Isolated from Deep Subsurface Sediments of the Baltic Sea

    Castillo, D., Vandieken, V., Engelen, B., Engelhardt, T. & Middelboe, Mathias, 2018, I : Genome Announcements. 6, 10, s. 1-2 e00081-18.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  20. Udgivet

    Exploring the Effect of Phage Therapy in Preventing Vibrio anguillarum Infections in Cod and Turbot Larvae

    Rørbo, N. I., Rønneseth, A., Kalatzis, Panagiotis, Rasmussen, B. B., Engell-Sørensen, K., Kleppen, H. P., Wergeland, H. I., Gram, L. & Middelboe, Mathias, 2018, I : Antibiotics. 7, 2, 15 s., 42.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  21. Udgivet

    Widespread distribution of prophage-encoded virulence factors in marine Vibrio communities

    Castillo, D., Kauffman, K., Hussain, F., Kalatzis, Panagiotis, Rørbo, N., Polz, M. F. & Middelboe, Mathias, 2018, I : Scientific Reports. 8, s. 1-9 9973.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  22. 2017
  23. Udgivet

    Isolation and characterization of a N4-like lytic bacteriophage infecting Vibrio splendidus, a pathogen of fish and bivalves

    Katharios, P., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C., Sarropoulou, E. & Middelboe, Mathias, 28 dec. 2017, I : PLoS ONE. 12, 12, 14 s., e0190083.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  24. Udgivet

    Marine viruses: key players in marine ecosystems

    Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., okt. 2017, I : Viruses. 9, 10, 6 s., 302.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftLederForskning

  25. Udgivet

    Stumbling across the same phage: comparative genomics of widespread temperate phages infecting the fish pathogen Vibrio anguillarum

    Kalatzis, Panagiotis, Rørbo, N. I., Castillo Bermúdez, D. E., Mauritzen, J. J., Jørgensen, Jóhanna, Kokkari, C., Zhang, F., Katharios, P. & Middelboe, Mathias, 20 maj 2017, I : Viruses. 9, 5, 19 s., 122.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  26. Udgivet

    Comparative genome analyses of Vibrio anguillarum strains reveal a link with pathogenicity traits

    Castillo Bermúdez, D. E., Alvise, P. D., Xu, R., Zhang, F., Middelboe, Mathias & Gram, L., 28 feb. 2017, I : mSystems. 2, 1, 14 s., e00001-17.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  27. Udgivet

    Carbon bioavailability in a high arctic fjord influenced by glacial meltwater, NE Greenland

    Paulsen, M. L., Nielsen, S. E. B., Müller, O., Møller, E. F., Stedmon, C. A., Juul-Pedersen, T., Markager, S., Sejr, M. K., Delgado Huertas, A., Larsen, A. & Middelboe, Mathias, 2017, I : Frontiers in Marine Science. 4, 19 s., 176.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  28. Udgivet

    Global occurrence and heterogeneity of the Roseobacter-clade species Ruegeria mobilis

    Sonnenschein, E. C., Nielsen, K. F., D'Alvise, P., Porsby, C. H., Melchiorsen, J., Heilmann, J., Kalatzis, Panagiotis, López-Pérez, M., Bunk, B., Spröer, C., Middelboe, Mathias & Gram, L., 2017, I : The ISME Journal. 11, s. 569-583 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  29. 2016
  30. Udgivet

    Benthic carbon mineralization in hadal trenches: assessment by in situ O2 microprofile measurements

    Wenzhöfer, F., Oguri, K., Middelboe, Mathias, Turnewitsch, R., Toyofuku, T., Kitazato, H. & Glud, R. N., 2016, I : Deep-Sea Research. Part 1: Oceanographic Research Papers. 116, s. 276-286 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  31. Udgivet

    Comparative genome analysis provides Insights into the pathogenicity of Flavobacterium psychrophilum

    Castillo Bermúdez, D. E., Christiansen, R. H., Dalsgaard, I., Madsen, L., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2016, I : P L o S One. 11, 4, 18 s., e0152515.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  32. Udgivet

    Effect of bacteriophages on the growth of Favobacterium psychrophilum and development of phage-resistant strains

    Christiansen, R. H., Madsen, L., Dalsgaard, I., Castillo Bermúdez, D. E., Kalatzis, P. G. & Middelboe, Mathias, 2016, I : Microbial Ecology. 71, 4, s. 845-859 15 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  33. Udgivet

    Genomic diversity of bacteriophages infecting the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum

    Castillo Bermúdez, D. E. & Middelboe, Mathias, 2016, I : F E M S Microbiology Letters. 363, 24, 6 s., fnw272.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  34. Udgivet

    Predation and selection for antibiotic resistance in natural environments

    Leisner, Jørgen, Jørgensen, Niels O. G. & Middelboe, Mathias, 2016, I : Evolutionary Applications (Online). 9, 3, s. 427-434 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  35. Udgivet

    Quantification of viral and prokaryotic production rates in benthic ecosystems: a methods comparison

    Rastelli, E., Dell'Anno, A., Corinaldesi, C., Middelboe, Mathias, Noble, R. T. & Danovaro, R., 2016, I : Frontiers in Microbiology. 7, 11 s., 1501.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  36. Udgivet

    Re-examination of the relationship between marine virus and microbial cell abundances

    Wigington, C. H., Sonderegger, D., Brussaard, C. P. D., Buchan, A., Finke, J. F., Fuhrman, J. A., Lennon, J. T., Middelboe, Mathias, Suttle, C. A., Wilson, W. H., Wommack, K. E., Wilhelm, S. W. & Weitz, J. S., 2016, I : Nature Microbiology. 1, 8 s., 15024 .

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  37. 2015
  38. Udgivet

    A multitrophic model to quantify the effects of marine viruses on microbial food webs and ecosystem processes

    Weitz, J. S., Stock, C. A., Wilhelm, S. W., Bourouiba, L., Coleman, M. L., Buchan, A., Follows, M. J., Fuhrman, J. A., Jover, L. F., Lennon, J. T., Middelboe, Mathias, Sonderegger, D. L., Suttle, C. A., Taylor, B. P., Frede Thingstad, T., Wilson, W. H. & Eric Wommack, K., 2015, I : ISME Journal. 9, s. 1352–1364 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  39. Udgivet

    Autofluorescence imaging system to discriminate and quantify the distribution of benthic cyanobacteria and diatoms

    Carreira, C., Staal, M. J., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : Limnology and Oceanography: Methods. 13, 4, s. 169-177 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  40. Udgivet

    Bacteriophage resistance mechanisms in the fish pathogen Flavobacterium psychrophilum: linking genomic mutations to changes in bacterial virulence factors

    Castillo Bermúdez, D. E., Cristiansen, R. H., Dalsgaard, I., Madsen, L. & Middelboe, Mathias, 2015, I : Applied and Environmental Microbiology. 81, 3, s. 1157-1167 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  41. Udgivet

    Changes in the composition and bioavailability of dissolved organic matter during sea ice formation

    Jørgensen, L., Stedmon, C. A., Kaartokallio, H., Middelboe, Mathias & Thomas, D. N., 2015, I : Limnology and Oceanography. 60, 3, s. 817-830 14 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  42. Udgivet

    Counting viruses and bacteria in photosynthetic microbial mats

    Carreira, C., Staal, M. J., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : Applied and Environmental Microbiology. 81, 6, s. 2149-2155 7 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  43. Udgivet

    Disruption of photoautotrophic intertidal mats by filamentous fungi

    Carreira, C., Staal, M. J., Falkoski, D., de Vries, R. P., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : Environmental Microbiology. 17, 8, s. 2910-2921 12 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  44. Udgivet

    Draft genome sequence of Vibrio parahaemolyticus VH3, isolated from an Aquaculture environment in Greece

    Castillo Bermúdez, D. E., Jun, J. W., D'Alvise, P., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S. & Katharios, P., 2015, I : Genome Announcements. 3, 4, 2 s., e00731-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  45. Udgivet

    Draft genome sequences of Vibrio alginolyticus strains V1 and V2, opportunistic marine pathogens

    Castillo Bermúdez, D. E., D'Alvise, P., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S. & Katharios, P., 2015, I : Genome Announcements. 3, 4, 2 s., e00729-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  46. Udgivet

    Draft genome sequences of the fish pathogen Vibrio harveyi strains VH2 and VH5

    Castillo Bermúdez, D. E., D'Alvise, P., Middelboe, Mathias, Gram, L., Liu, S., Kalatzis, Panagiotis, Kokkari, C. & Katharios, P., 2015, I : Genome Announcements. 3, 5, 2 s., e01062-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  47. Udgivet

    Microscale spatial distributions of microbes and viruses in intertidal photosynthetic microbial mats

    Carreira, C., Piel, T., Staal, M. J., Stuut, J. W., Middelboe, Mathias & Brussaard, C. P. D., 2015, I : SpringerPlus. 4, 11 s., 239.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  48. Udgivet

    Oceanography and the base of the pelagic food web in the southern Indian Ocean

    Visser, A. W., Nielsen, T. G., Middelboe, Mathias, Høyer, J. L. & Markager, S., 2015, I : Journal of Plankton Research. 37, 3, s. 571-583 13 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  49. Udgivet

    Quorum sensing determines the choice of antiphage defense strategy in Vibrio anguillarum

    Tan, D., Svenningsen, Sine Lo & Middelboe, Mathias, 2015, I : mBio. 6, 3, 10 s., e00627-15.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  50. Udgivet

    Vibriophages differentially influence biofilm formation by Vibrio anguillarum strains

    Tan, D., Dahl, A. & Middelboe, Mathias, 2015, I : Applied and Environmental Microbiology. 81, 13, s. 4489-4497 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  51. 2014
  52. Udgivet

    Antagonistic coevolution of marine planktonic viruses and their hosts

    Martiny, J. B. H., Riemann, Lasse, Marston, M. F. & Middelboe, Mathias, 2014, I : Annual Review of Marine Science. 6, s. 393-414 22 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  53. Udgivet

    Complete genome sequence of Vibrio anguillarum phage CHOED successfully used for phage therapy in aquaculture

    Romero, J., Higuera, G., Gajardo, F., Castillo Bermúdez, D. E., Middelboe, Mathias, García, K., Ramírez, C. & Espejo, R. T., 2014, I : Genome Announcements. 2, 4, 2 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  54. Udgivet

    Detection and quantification of Flavobacterium psychrophilum-specific bacteriophages In Vivo in rainbow trout upon oral administration: implications for disease control in aquaculture

    Christiansen, R. H., Dalsgaard, I., Middelboe, Mathias, Lauritsen, A. H. & Madsen, L., 2014, I : Applied and Environmental Microbiology. 80, 24, s. 7683-7693 11 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  55. Udgivet

    Dissecting the role of viruses in marine nutrient cycling: bacterial uptake of D- and L-amino acids released by viral lysis

    Shelford, E. J., Jørgensen, Niels O. G., Rasmussen, S., Suttle, C. A. & Middelboe, Mathias, 2014, I : Aquatic Microbial Ecology. 73, 3, s. 235-243 9 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  56. Udgivet

    Diversity and geographical distribution of Flavobacterium psychrophilum isolates and their phages: patterns of susceptibility to phage infection and phage host range

    Castillo Bermúdez, D. E., Christiansen, R. H., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2014, I : Microbial Ecology. 67, 4, s. 748-757 10 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

  57. Udgivet

    Genomic structure of bacteriophage 6H and its distribution as prophage in Flavobacterium psychrophilum strains

    Castillo Bermúdez, D. E., Espejo, R. & Middelboe, Mathias, 2014, I : FEMS Microbiology Letters. 351, 1, s. 51-58 8 s.

    Publikation: Bidrag til tidsskriftTidsskriftartikelForskningfagfællebedømt

Forrige 1 2 3 Næste

ID: 8392